Simona è Professoressa Associata di Genomica Umana presso l'Università di Roma Sapienza, dove attualmente dirige il suo laboratorio di ricerca, il Giunta Lab, per capire il ruolo dell'instabilità genomica nelle malattie degenerative come il cancro e l'invecchiamento. È inoltre docente di Genome Evolution e Cell Cycle per il Corso di Laurea in Magistrale in Genetica e Biologia Molecolare. Dopo la laurea in Biologia del Cancro presso la Brunel di Londra (Regno Unito), ha conseguito un dottorato di ricerca in Cancer Research presso l'Università di Cambridge nel laboratorio del Prof. Steve Jackson dove ha studiato la riparazione del danno al DNA durante la mitosi. Ha lavorato come ricercatrice presso il reattore nucleare dell'EMBL / ILL (Francia) e come Fellow UICC per condurre un nuovo studio su cancro e nutrizione presso il CSIRO (Australia). È stata poi ricercatrice presso la Rockefeller University di New York (USA) per quasi 10 anni, supportata da una Women & Science Fellowship, l'American Italian Cancer Foundation Fellowship, e finanziamenti dalla Tri-Institutional Stem Cell Initiative con Sloan Kettering Cancer Hospital ed NIH. Dopo quasi due decenni all'estero, le è stata conferita la Marie Curie Reintegration Fellowship, il premio Rita Levi Montalcini "Rientro dei Cervelli" dal Ministero della Ricerca ed Istruzione, il finanziamento SEAL of Excellence della Sapienza ed uno Start-Up Grant dall'AIRC, permettendole di tornare nella sua città natale, Roma, e di iniziare il suo programma di ricerca in Genome Evolution in Italia. Nel 2022, Simona ha ricevuto l'ERC Starting Grant, il finanziamento alla ricerca più importante nella Comunità Europea, per continuare il lavoro sull'instabilità delle sequenze ripetute nel DNA umano. Simona Giunta è Presidente e Fondatrice di una non-profit (ONG) per la divulgazione scientifica, Know Science Inc. (USA) e co-founder del Genome Integrity Italian Network (GiiN), consulente scientifico per le Nazioni Unite ed è una grande sostenitrice della comunicazione scientifica e della parità di genere in STEM.